【前言：小猫于今日结束了《最终进化》的第一季，谢谢广大的读者，本节也是第一季的终篇了，欢迎大家给意见！】
原人类一直无法让外保护层显现出来，但比尔这个外保护层的确是能很好的保护原人类，乔和简都被关在监禁室里，就因为外保护层的原因，但是他们各有疑问，乔疑问的是他自己突然的另一个人格到底是哪里来的，简则疑问为何他联系不上马丁，难道马丁和他一样是最终进化体。但是，这又说不通，简回想起他被克隆前本尊的记忆。
“简…等一下。”乔拦住了本尊，“你真的决定这么做吗？”
简无奈地笑了，“兄弟，难道我不应该上交我们的最新的研究方案吗？”简手中有着一份报告。
乔露出了焦急的样子，“简，我想说的是，这是最终进化体的报告，也就是说只有用我们的细胞才可以克隆的。”
简则一副自豪的样子，凑到乔耳边，“兄弟，我很庆幸我是目前唯一能进行超高级克隆体的人，也就是说我们快多一个兄弟了。”
乔抓住了简的手：“你想想，我之所以被克隆的原因，还有，为什么我不能以你的身份出现，只能以你眼前这个已死去的人出现。”
简看着乔，一会儿后，把报告抓紧，“不…我不能这样，我是被这荣要冲昏了头，我不能变得像他们一样，就像你说的，我被马丁利用了！我现在就粉碎这份研究报告。”乔也欣慰地笑了笑。这也是简最后一次在记忆恢复仪上看到的景象，也就是说，这技术只有简和乔知道，而且克隆最终进化体与超高级克隆体有着同样苛刻的条件，且艾森当时没有去检测是否符合克隆条件。但他现在还不知道当初简放弃了克隆他后，现在他为什么又被克隆出来，简对于之后的事他怎么靠自己也无法想起来。于是他想联通乔，问是为什么？他集中精神，周围的生命体一个个出现了，这时他感受到一个颤动的生命信息，这个生命信息时而微弱时而强大，而且在这个生命中似乎存有两个生命信息，简觉得非常奇怪，于是他冒险一下，想联通上，当他联系上的时候，他只听见心跳声和呼吸声，却无法进入对方的思想，就像马丁一样，但那个生命个体并不是马丁，正当他郁闷是谁的时候，那个生命信息又浮动了一下，他进入了一个微弱生命的思想，“珍妮！”简惊叹一声。他再综合分析一下，恩皮应该没有而且他还附着在珍妮的思想中，恩皮到时是什么？这个问题让简延伸了无限的恐惧。
“乔？”凯文成功地解下克隆人研究所的精神干扰器了，他利用智能芯片模拟出的强烈脑电波向乔发出了信号。
原人类这边的干扰器早在简进来就让他屏蔽了电波，乔也接收到了凯文的信息了，乔也马上回应，并联系上了简。现在，这才是真正地启动了“JD计划”，只是现在少了昆，简也试着联系上昆，但是他感应的昆并不是昆，而是与马丁有一样的感觉，难道昆也被克隆了吗？这又不可能，因为昆并不符合超高级克隆体的克隆条件，简这次则猜测他们是同一种人包括恩皮在内，他们之间一定有某种联系，不然简也不可能联系不上他们。
简这才问起乔，“乔…为什么我被克隆，当时你不是地方案毁了吗？”
这个问题还是被问起来了，“因为本尊死了…”
对于这个回答实有有些牵强，简也意识到自己被克隆出来决不单于本尊死了这方面的原因，但他觉得乔没有理由骗他，或这只是其中一方面的原因，但简想知道最终的原因，于是他还是问了：“本尊死了，难道你就不能主持大局吗？”
“嗯，这个我也想告诉你，我虽然是超高级进化体，但这也叫极端进化体，我拥有智力却不拥有武力，我们团队中，只有昆是武智双全的，但是，高级克隆体在本尊死的那年就增加了2个，我怕我们敌不过克隆人或原人类，只好克隆出你…”乔解释得不清不楚，简也感受得到。
对于这个被克隆的问题也不必深究下去了，因为继续下去也没有个结果，简就问了其他事：“乔…你记得安德鲁吗？”
乔突然站了起来，没有说什么，但显得情绪有点波动，简没有接到乔的回应，就叫了他几声，乔这才回应他，“安德鲁，本尊的父母死前，简就叫安德鲁…”看来乔知道一些事，简紧接着问：“那你知道本尊父母是为什么死的吗？还有是谁做的吗？”
乔犹豫了许久，才想跟简说些什么，但他们却突然断了联系，原来是珍妮过来看简了，“你好，简。”珍妮隔着强化玻璃跟简对话。
“你来干什么？”简感觉这个人就是恩皮。
珍妮靠近玻璃，“我想救你，这一切都是马丁计划的。”
简怀疑地说到：“要不是因为琼斯，马丁能这么做吗？”
珍妮这才露出阴险的笑容：“你比我想象的聪明，居然能知道我是谁。”
“我说你也太高估我了，要是我能知道你是什么，这太能算得上聪明…”简意思是在问恩皮是怎么出现的。
珍妮退了几步，便说：“事实上，我是来放你出来的，只要你能跟我合作。”
“那我有条件，放了乔和琼斯。”
“乔我自然会放他的，至于琼斯，她是我们留在研究所的唯一筹码，她要得到我统领地球之后才能放出来。”恩皮根本不想和简达成什么合作，他最主要的目的还是统治地球。
“那你也不必放了我了。”简决意不想跟他合作。
“事实上，你不想合作我也要放了你，但这放我就连乔也不会放…”恩皮是在威胁简吗？
对于简，这的确是在威胁，简也不任他摆布了，大不了他再复活珍妮，于是他手一用劲，直接打碎了强化玻璃，跑了出来，想让恩皮消失。
然，恩皮则很镇定，“要是我，我就不会这么做。”当简要打到他的时候，他也察觉到有几束激光向他射过来了，他马上跳开。“最好和保持5米以上，现在防御系统又多了我一个保护对象，看来你也让它纳入危险事物的范围中了。”恩皮一副很藐视简的样子，“不过，强化玻璃连高级克隆体都打不碎的，看来你不简单。”
简退了几步，恩皮好像知道他的一些事，“你到底是谁，还知道什么？”
“我？我以为你知道的…”珍妮脸上的奸笑只有恩皮才笑得出的。
简又产生了疑问，他边看着恩皮边想他做过的事，但这毫无所获，于是简想进入他的思想，看看能知道些什么，就在他集中精神的时侯，他突然感觉到呼吸困难，意识也有些模糊。
“比尔，把你的光波层的构造原理跟我讲一遍，我们没时间了，乔在马丁手上，我们现在必须让克隆人与原人类向危险妥协。”比尔接到了简的信息，这让他很疑问，因为之前联系上还说他们的计划才开始，现在又那么突然。比尔迟迟没有回应，他又接到简的回应：“我打碎强化玻璃，因为他们要杀了乔，乔被困在有干扰电波的房间内了，人必须攻破克隆人的外保护层，不然我们以后很难进入原人类的研究所了，现在我让研究所的所有门都关了，马丁在半小时之内会攻破我设定的程序的，现在我没时间了。”
凯文因为知道简之前为了救乔而做出的那事举动，凯文也相信了他，于是让比尔告诉了简光波层的构造。
艳阳高照，坏天气也是过去的事了，蓝天下飞过一群鸟儿，冬天也正式来临了，风也并不是很冷，往年秋末冬初的好天气，郊外总是有很多人在野营。而今天，郊外那些泛黄的草地却如此苍茫，繁华的大街也落得如此悲凉，依然是行同陌路的人，没有更多的语言交流。
“Boow！”克隆人的研究所也遭到轰炸了，他们的外保护层也消失了，克隆人同样像原人类一样惊慌失措，接着又是连续轰炸，在没有外保护层的轰炸下，克隆人本已绝望了，但这却像原人类受攻击时被吸收了，于是这一侥幸的逃离危险，让所有克隆人探个究竟。
“你好，简！”简来到乔面前，他居然叫乔为简。
这时的乔又联系不上简了，他也知道眼前的人还是简了，“你想干什么？”
“没有！我只是来向你道别的，只是道别之前我想叫回你原来的名字，不过很可惜你们的计划失败了，不过我还是想让你看看这个。”简扔出一个立体放映机，呈现出的影像是克隆人的研究所，“你不知道是为什么，你以后也不会知道是为什么的。”简露出了阴险的笑。
就在乔疑惑时，影像中的研究所却爆炸了，整一个研究所爆炸了，乔才意识到那是比尔的光波层的威力，这也意味着比尔和凯文连同研究所一起毁灭了，同时他也感觉到他们的计划彻底地失败了。接着，他眼前的简把监禁室的门开了出来，然后就扔了一个玻璃容器进去，再关上了门，“这就是简研究的菌种，还有，我叫恩皮·布兰。”说完他就走了。
乔这次觉得自己已经不再幸运了，在克隆出最终进化体之后，他预测到的未来并不是这样的，他呼吸困难，慢慢地慢慢地…他倒下了。
……
……
呼吸声，心跳声，还有液体流动的声音，“我…我还没死？这是哪…我怎么在水中？”乔嘴里含着一根输氧管，他睁开眼，眼前模糊不清，还有着微弱的灯光…